Construit au Moyen Âge, le bâtiment a été rénové en 1525, lorsque l’aristocrate Costanza de’ Rossi a acheté pour le compte de la Confrérie Saint-Roch les « case ruinate degli Onara ». La confrérie a utilisé le bâtiment pour tenir les réunions du chapitre et elle a ouvert un chantier artistique où ont convergé les plus grandes personnalités de l’art padouan de la première moitié du XVIe siècle. Les travaux de rénovation ont été achevés en 1542, lorsque l’évêque a béni l’oratoire.
Les murs de la salle inférieure sont superbement décorés de fresques illustrant des épisodes de la vie de Saint-Roch. La fausse colonnade, les fenêtres et les oculi créent un joli effet trompe-l’œil grâce aux carrés architecturaux surmontés de frises et de décorations dans le style de l’art grotesque. Le cycle alterne des vues de paysages et d’intérieurs domestiques, et a été réalisé entre 1536 et 1545 par Domenico Campagnola, Girolamo Tessari dit « dal Santo », Gualtiero Padovano et Stefano Dall’Arzere, célèbres peintres actifs dans la région et disciples de l’école vénitienne. La salle supérieure, non accessible au public, est décorée d’autres fresques de Campagnola et d’un précieux dossal de Tiziano Minio.
Avec l’abolition des confréries à l’époque napoléonienne, l’école a été transférée à l’État et a été achetée par la municipalité au début du XXe siècle. L’Oratoire a fait l’objet de deux campagnes de restauration visant à valoriser, préserver et analyser l’état des fresques, des matériaux et des techniques utilisées. Aujourd’hui, l’Oratoire accueille de nombreuses expositions temporaires.